Em recente recomendação de fevereiro de 2016, o CDC alerta sobre os seguintes tópicos referentes ao diagnóstico da infecção causada pelo Zika Vírus:
- Nos 7 primeiros dias de doença, o RT-PCR apresenta maior sensibilidade para detecção de flavivírus, ou a pesquisa do antígeno NS1 através de ELISA, especificamente no caso do vírus da dengue.
- A sorologia pode ser coletada a partir do 4o. dia do início dos sintomas, mas é mais sensato aguardar o 7o. dia.
- IgM persiste positivo por 2 a 12 semanas.IgM negativo 2 a 12 semanas após viagem para região de risco indica que não houve contágio.
- A interpretação de resultados positivos, em especial do IgM deve ser cautelosa, pois há reatividade cruzada com outros flavivírus, inclusive o vírus da dengue.


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